En el proceso de almacenaje de las frutas y hortalizas, la limpieza se suele centrar en la limpieza de cámaras, cajas y cintas transportadoras, por lo que se llevan a cabo protocolos muy básicos, salvo que tenga lugar una manipulación de cuarta o quinta gama de los productos (mayor manipulación y envasado de productos).

En la limpieza y desinfección de estas naves se suele recurrir a:

Detergentes alcalinos espumantes IA-751 o alcalino clorados espumantes IA-703C para la limpieza y desinfección general y de las cajas .

Detergentes desinfectantes en base amonio cuaternario para la limpieza de las cintas transportadoras, clasificadoras, maquinaria de procesado… por donde transcurren los alimentos H-331.

Para desinfectar las cajas de aluminio de los vehículos de transporte, son necesarios amonios cuaternarios como H-331, Deterquat o detergentes alcalinos combinados con un desinfectante terminal.

Atención a los clorados ya que generan corrosión en el aluminio.